Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TMIGD3P0DMS9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMIGD3P0DMS9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms