Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBBP0CG47 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UBBP0CG47 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UBBP0CG47 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms