Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
POLA1P09884 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
POLA1P09884 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
POLA1P09884 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
POLA1P09884 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.98
POLA1P09884 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
POLA1P09884 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
POLA1P09884 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
POLA1P09884 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
POLA1P09884 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
POLA1P09884 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
POLA1P09884 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
POLA1P09884 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
POLA1P09884 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
POLA1P09884 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
POLA1P09884 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
POLA1P09884 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
POLA1P09884 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
POLA1P09884 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
POLA1P09884 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
POLA1P09884 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
POLA1P09884 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLA1P09884 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLA1P09884 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLA1P09884 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
POLA1P09884 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
POLA1P09884 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
POLA1P09884 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
POLA1P09884 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
POLA1P09884 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
POLA1P09884 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC39.78■■■■□ 3.96
POLA1P09884 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
POLA1P09884 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLA1P09884 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLA1P09884 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLA1P09884 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
POLA1P09884 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
POLA1P09884 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
POLA1P09884 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
POLA1P09884 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
POLA1P09884 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
POLA1P09884 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
POLA1P09884 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
POLA1P09884 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.72■■■■□ 3.95
POLA1P09884 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
POLA1P09884 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
POLA1P09884 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
POLA1P09884 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
POLA1P09884 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
POLA1P09884 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
POLA1P09884 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
POLA1P09884 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
POLA1P09884 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
POLA1P09884 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
POLA1P09884 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
POLA1P09884 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
POLA1P09884 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLA1P09884 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLA1P09884 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLA1P09884 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
POLA1P09884 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
POLA1P09884 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.65■■■■□ 3.94
POLA1P09884 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms