Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MGPP08493 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MGPP08493 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MGPP08493 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MGPP08493 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MGPP08493 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MGPP08493 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MGPP08493 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MGPP08493 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MGPP08493 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MGPP08493 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MGPP08493 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MGPP08493 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MGPP08493 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms