Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ABCB1P08183 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ABCB1P08183 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms