Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CENPBP07199 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CENPBP07199 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CENPBP07199 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CENPBP07199 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CENPBP07199 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CENPBP07199 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CENPBP07199 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPBP07199 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPBP07199 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CENPBP07199 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CENPBP07199 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPBP07199 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPBP07199 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPBP07199 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPBP07199 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CENPBP07199 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CENPBP07199 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CENPBP07199 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPBP07199 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPBP07199 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPBP07199 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPBP07199 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CENPBP07199 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPBP07199 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPBP07199 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPBP07199 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CENPBP07199 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPBP07199 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPBP07199 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CENPBP07199 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPBP07199 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPBP07199 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CENPBP07199 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPBP07199 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CENPBP07199 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CENPBP07199 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CENPBP07199 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPBP07199 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPBP07199 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPBP07199 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPBP07199 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPBP07199 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CENPBP07199 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CENPBP07199 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPBP07199 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPBP07199 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CENPBP07199 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CENPBP07199 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms