Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NEFLP07196 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NEFLP07196 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NEFLP07196 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NEFLP07196 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFLP07196 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFLP07196 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFLP07196 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NEFLP07196 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFLP07196 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFLP07196 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFLP07196 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NEFLP07196 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NEFLP07196 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFLP07196 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFLP07196 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFLP07196 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFLP07196 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NEFLP07196 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFLP07196 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFLP07196 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFLP07196 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFLP07196 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NEFLP07196 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
NEFLP07196 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFLP07196 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFLP07196 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
NEFLP07196 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFLP07196 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFLP07196 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
NEFLP07196 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
NEFLP07196 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NEFLP07196 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
NEFLP07196 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEFLP07196 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEFLP07196 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEFLP07196 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEFLP07196 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEFLP07196 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms