Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGAVP06756 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGAVP06756 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGAVP06756 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms