Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOA4P06727 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOA4P06727 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOA4P06727 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOA4P06727 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOA4P06727 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA4P06727 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
APOA4P06727 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
APOA4P06727 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOA4P06727 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA4P06727 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOA4P06727 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
APOA4P06727 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms