Protein–RNA interactions for Protein: P05937

CALB1, Calbindin, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB1P05937 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CALB1P05937 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CALB1P05937 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALB1P05937 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALB1P05937 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALB1P05937 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALB1P05937 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALB1P05937 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALB1P05937 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALB1P05937 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALB1P05937 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALB1P05937 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALB1P05937 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms