Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYBBP04839 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYBBP04839 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYBBP04839 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYBBP04839 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYBBP04839 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYBBP04839 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYBBP04839 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYBBP04839 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYBBP04839 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYBBP04839 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYBBP04839 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYBBP04839 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYBBP04839 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYBBP04839 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYBBP04839 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYBBP04839 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYBBP04839 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYBBP04839 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYBBP04839 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CYBBP04839 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CYBBP04839 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CYBBP04839 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CYBBP04839 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms