Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGBP02675 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGBP02675 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGBP02675 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGBP02675 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGBP02675 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FGBP02675 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FGBP02675 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FGBP02675 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGBP02675 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGBP02675 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGBP02675 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGBP02675 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FGBP02675 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGBP02675 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGBP02675 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGBP02675 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGBP02675 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FGBP02675 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGBP02675 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGBP02675 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
FGBP02675 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGBP02675 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FGBP02675 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FGBP02675 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FGBP02675 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGBP02675 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGBP02675 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGBP02675 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FGBP02675 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGBP02675 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
FGBP02675 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGBP02675 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGBP02675 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGBP02675 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FGBP02675 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FGBP02675 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGBP02675 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FGBP02675 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FGBP02675 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FGBP02675 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FGBP02675 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGBP02675 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGBP02675 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGBP02675 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FGBP02675 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FGBP02675 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FGBP02675 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms