Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGAP02671 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGAP02671 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGAP02671 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGAP02671 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGAP02671 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGAP02671 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGAP02671 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGAP02671 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGAP02671 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGAP02671 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FGAP02671 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGAP02671 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FGAP02671 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FGAP02671 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FGAP02671 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGAP02671 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FGAP02671 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FGAP02671 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FGAP02671 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGAP02671 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGAP02671 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGAP02671 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGAP02671 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FGAP02671 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGAP02671 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGAP02671 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGAP02671 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FGAP02671 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
FGAP02671 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FGAP02671 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGAP02671 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGAP02671 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGAP02671 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
FGAP02671 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FGAP02671 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGAP02671 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGAP02671 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
FGAP02671 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGAP02671 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FGAP02671 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FGAP02671 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGAP02671 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGAP02671 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FGAP02671 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FGAP02671 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FGAP02671 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGAP02671 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGAP02671 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGAP02671 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGAP02671 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FGAP02671 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGAP02671 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGAP02671 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGAP02671 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGAP02671 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FGAP02671 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FGAP02671 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FGAP02671 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FGAP02671 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms