Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC2P02655 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOC2P02655 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC2P02655 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC2P02655 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC2P02655 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC2P02655 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOC2P02655 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOC2P02655 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOC2P02655 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC2P02655 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOC2P02655 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOC2P02655 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOC2P02655 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC2P02655 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC2P02655 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC2P02655 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC2P02655 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOC2P02655 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOC2P02655 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC2P02655 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC2P02655 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOC2P02655 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOC2P02655 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOC2P02655 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
APOC2P02655 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
APOC2P02655 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
APOC2P02655 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
APOC2P02655 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms