Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOA1P02647 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOA1P02647 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOA1P02647 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOA1P02647 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
APOA1P02647 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
APOA1P02647 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
APOA1P02647 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
APOA1P02647 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOA1P02647 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms