Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFP01375 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TNFP01375 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFP01375 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFP01375 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TNFP01375 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TNFP01375 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TNFP01375 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TNFP01375 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFP01375 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFP01375 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFP01375 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFP01375 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TNFP01375 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFP01375 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFP01375 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFP01375 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TNFP01375 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFP01375 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFP01375 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFP01375 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFP01375 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNFP01375 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFP01375 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFP01375 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms