Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TIMP1P01033 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TIMP1P01033 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TIMP1P01033 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms