Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C1RP00736 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C1RP00736 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
C1RP00736 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C1RP00736 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C1RP00736 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1RP00736 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1RP00736 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1RP00736 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1RP00736 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1RP00736 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1RP00736 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1RP00736 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1RP00736 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1RP00736 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1RP00736 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1RP00736 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1RP00736 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1RP00736 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1RP00736 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1RP00736 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1RP00736 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1RP00736 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1RP00736 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1RP00736 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1RP00736 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1RP00736 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms