Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PAK4O96013 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PAK4O96013 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PAK4O96013 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PAK4O96013 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PAK4O96013 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAK4O96013 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAK4O96013 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PAK4O96013 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PAK4O96013 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PAK4O96013 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PAK4O96013 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK4O96013 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK4O96013 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK4O96013 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK4O96013 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PAK4O96013 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PAK4O96013 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PAK4O96013 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK4O96013 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK4O96013 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK4O96013 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PAK4O96013 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PAK4O96013 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAK4O96013 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PAK4O96013 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PAK4O96013 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK4O96013 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK4O96013 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK4O96013 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK4O96013 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PAK4O96013 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAK4O96013 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAK4O96013 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PAK4O96013 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms