Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX58O95786 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX58O95786 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX58O95786 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX58O95786 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX58O95786 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX58O95786 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX58O95786 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX58O95786 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX58O95786 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX58O95786 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX58O95786 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX58O95786 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX58O95786 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX58O95786 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX58O95786 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX58O95786 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX58O95786 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX58O95786 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX58O95786 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX58O95786 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX58O95786 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX58O95786 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX58O95786 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX58O95786 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX58O95786 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX58O95786 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX58O95786 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX58O95786 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX58O95786 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX58O95786 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX58O95786 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX58O95786 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX58O95786 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX58O95786 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX58O95786 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX58O95786 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX58O95786 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX58O95786 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX58O95786 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX58O95786 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX58O95786 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX58O95786 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DDX58O95786 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX58O95786 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX58O95786 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX58O95786 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX58O95786 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
DDX58O95786 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms