Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF1O95521 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF1O95521 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF1O95521 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms