Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SEC24BO95487 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SEC24BO95487 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SEC24BO95487 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEC24BO95487 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms