Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR4O95473 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR4O95473 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SYNGR4O95473 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms