Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOBTB3O94955 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOBTB3O94955 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOBTB3O94955 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms