Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UFL1O94874 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UFL1O94874 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UFL1O94874 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UFL1O94874 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UFL1O94874 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UFL1O94874 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UFL1O94874 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UFL1O94874 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UFL1O94874 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UFL1O94874 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UFL1O94874 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UFL1O94874 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
UFL1O94874 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UFL1O94874 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UFL1O94874 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UFL1O94874 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UFL1O94874 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UFL1O94874 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
UFL1O94874 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UFL1O94874 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UFL1O94874 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UFL1O94874 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UFL1O94874 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
UFL1O94874 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UFL1O94874 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UFL1O94874 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UFL1O94874 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UFL1O94874 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
UFL1O94874 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UFL1O94874 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UFL1O94874 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UFL1O94874 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UFL1O94874 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UFL1O94874 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UFL1O94874 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UFL1O94874 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UFL1O94874 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UFL1O94874 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
UFL1O94874 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UFL1O94874 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UFL1O94874 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UFL1O94874 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
UFL1O94874 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UFL1O94874 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UFL1O94874 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
UFL1O94874 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UFL1O94874 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UFL1O94874 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UFL1O94874 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UFL1O94874 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UFL1O94874 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UFL1O94874 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UFL1O94874 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UFL1O94874 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UFL1O94874 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UFL1O94874 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UFL1O94874 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UFL1O94874 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UFL1O94874 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UFL1O94874 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UFL1O94874 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms