Protein–RNA interactions for Protein: O75956

CDK2AP2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP2O75956 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK2AP2O75956 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDK2AP2O75956 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms