Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CCNKO75909 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CCNKO75909 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CCNKO75909 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CCNKO75909 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCNKO75909 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNKO75909 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNKO75909 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCNKO75909 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCNKO75909 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCNKO75909 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNKO75909 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNKO75909 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNKO75909 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCNKO75909 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCNKO75909 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCNKO75909 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms