Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SURF6O75683 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SURF6O75683 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SURF6O75683 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SURF6O75683 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SURF6O75683 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SURF6O75683 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SURF6O75683 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SURF6O75683 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SURF6O75683 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SURF6O75683 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SURF6O75683 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SURF6O75683 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SURF6O75683 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SURF6O75683 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SURF6O75683 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SURF6O75683 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SURF6O75683 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SURF6O75683 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SURF6O75683 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SURF6O75683 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SURF6O75683 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SURF6O75683 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SURF6O75683 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SURF6O75683 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SURF6O75683 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SURF6O75683 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SURF6O75683 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SURF6O75683 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SURF6O75683 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SURF6O75683 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SURF6O75683 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SURF6O75683 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SURF6O75683 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SURF6O75683 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SURF6O75683 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms