Protein–RNA interactions for Protein: O75596

CLEC3A, C-type lectin domain family 3 member A, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3AO75596 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLEC3AO75596 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLEC3AO75596 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLEC3AO75596 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms