Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GPC4O75487 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPC4O75487 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPC4O75487 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPC4O75487 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC4O75487 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC4O75487 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPC4O75487 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPC4O75487 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GPC4O75487 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPC4O75487 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPC4O75487 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPC4O75487 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPC4O75487 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC4O75487 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC4O75487 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPC4O75487 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms