Protein–RNA interactions for Protein: O75175

CNOT3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT3O75175 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNOT3O75175 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNOT3O75175 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNOT3O75175 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms