Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
NBNO60934 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBNO60934 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBNO60934 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBNO60934 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBNO60934 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NBNO60934 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBNO60934 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBNO60934 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBNO60934 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBNO60934 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NBNO60934 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBNO60934 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NBNO60934 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBNO60934 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NBNO60934 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBNO60934 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBNO60934 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBNO60934 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBNO60934 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NBNO60934 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NBNO60934 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBNO60934 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NBNO60934 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBNO60934 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBNO60934 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NBNO60934 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NBNO60934 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NBNO60934 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NBNO60934 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NBNO60934 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NBNO60934 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NBNO60934 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NBNO60934 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NBNO60934 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NBNO60934 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NBNO60934 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NBNO60934 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NBNO60934 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NBNO60934 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NBNO60934 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NBNO60934 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NBNO60934 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms