Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTNND1O60716 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNND1O60716 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CTNND1O60716 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND1O60716 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND1O60716 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CTNND1O60716 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNND1O60716 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNND1O60716 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CTNND1O60716 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNND1O60716 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND1O60716 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND1O60716 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNND1O60716 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms