Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP104O60308 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP104O60308 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP104O60308 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEP104O60308 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEP104O60308 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP104O60308 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP104O60308 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEP104O60308 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEP104O60308 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEP104O60308 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEP104O60308 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEP104O60308 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CEP104O60308 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEP104O60308 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEP104O60308 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEP104O60308 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEP104O60308 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEP104O60308 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms