Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATP9BO43861 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP9BO43861 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP9BO43861 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms