Protein–RNA interactions for Protein: O43809

NUDT21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT21O43809 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDT21O43809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUDT21O43809 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
NUDT21O43809 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUDT21O43809 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 433.5 ms