Protein–RNA interactions for Protein: O43795

MYO1B, Unconventional myosin-Ib, humanhuman

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1BO43795 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYO1BO43795 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYO1BO43795 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYO1BO43795 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms