Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLX3O43711 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLX3O43711 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLX3O43711 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLX3O43711 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TLX3O43711 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLX3O43711 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLX3O43711 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLX3O43711 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLX3O43711 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLX3O43711 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLX3O43711 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TLX3O43711 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TLX3O43711 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TLX3O43711 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TLX3O43711 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TLX3O43711 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms