Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB2O43679 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB2O43679 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB2O43679 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB2O43679 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB2O43679 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB2O43679 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB2O43679 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB2O43679 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB2O43679 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB2O43679 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB2O43679 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB2O43679 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB2O43679 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB2O43679 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDB2O43679 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDB2O43679 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB2O43679 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB2O43679 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms