Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SRGAP3O43295 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SRGAP3O43295 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP3O43295 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1188.1 ms