Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNN4O15554 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNN4O15554 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNN4O15554 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms