Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GSC2O15499 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GSC2O15499 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSC2O15499 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GSC2O15499 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSC2O15499 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GSC2O15499 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GSC2O15499 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSC2O15499 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSC2O15499 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSC2O15499 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GSC2O15499 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GSC2O15499 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GSC2O15499 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GSC2O15499 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSC2O15499 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSC2O15499 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GSC2O15499 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GSC2O15499 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GSC2O15499 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GSC2O15499 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GSC2O15499 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms