Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FANCAO15360 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FANCAO15360 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FANCAO15360 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FANCAO15360 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FANCAO15360 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
FANCAO15360 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FANCAO15360 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FANCAO15360 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCAO15360 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCAO15360 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCAO15360 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FANCAO15360 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FANCAO15360 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FANCAO15360 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FANCAO15360 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FANCAO15360 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FANCAO15360 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FANCAO15360 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCAO15360 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FANCAO15360 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCAO15360 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCAO15360 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCAO15360 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCAO15360 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FANCAO15360 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FANCAO15360 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FANCAO15360 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FANCAO15360 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FANCAO15360 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FANCAO15360 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FANCAO15360 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FANCAO15360 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FANCAO15360 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FANCAO15360 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FANCAO15360 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FANCAO15360 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FANCAO15360 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FANCAO15360 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FANCAO15360 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FANCAO15360 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FANCAO15360 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FANCAO15360 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
FANCAO15360 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
FANCAO15360 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
FANCAO15360 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FANCAO15360 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FANCAO15360 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FANCAO15360 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FANCAO15360 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FANCAO15360 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FANCAO15360 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
FANCAO15360 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FANCAO15360 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
FANCAO15360 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FANCAO15360 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FANCAO15360 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FANCAO15360 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FANCAO15360 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FANCAO15360 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
FANCAO15360 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
FANCAO15360 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCAO15360 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCAO15360 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCAO15360 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FANCAO15360 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms