Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPTLC2O15270 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPTLC2O15270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPTLC2O15270 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPTLC2O15270 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms