Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A1O15245 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC22A1O15245 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC22A1O15245 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms