Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SEMA3EO15041 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SEMA3EO15041 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SEMA3EO15041 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms