Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF5O14894 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TM4SF5O14894 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TM4SF5O14894 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms