Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDC80O14777 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDC80O14777 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDC80O14777 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC80O14777 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC80O14777 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDC80O14777 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC80O14777 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC80O14777 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDC80O14777 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NDC80O14777 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC80O14777 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC80O14777 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC80O14777 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC80O14777 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NDC80O14777 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NDC80O14777 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC80O14777 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC80O14777 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC80O14777 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NDC80O14777 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NDC80O14777 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NDC80O14777 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC80O14777 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC80O14777 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC80O14777 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NDC80O14777 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms