Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTPRTO14522 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PTPRTO14522 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PTPRTO14522 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRTO14522 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms