Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
GOLIM4O00461 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GOLIM4O00461 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GOLIM4O00461 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms